Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sf3b5Q923D4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms