Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Spdl1Q923A2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Spdl1Q923A2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms