Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Odf3Q920N1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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