Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usb1Q91W78 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usb1Q91W78 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms