Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Klc3Q91W40 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Klc3Q91W40 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms