Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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Smg8Q8VE18 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Smg8Q8VE18 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.77■□□□□ 0.59
Smg8Q8VE18 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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