Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fyco1Q8VDC1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Fyco1Q8VDC1 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms