Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Fam20bQ8VCS3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Fam20bQ8VCS3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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