Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH7

Rdh10, Retinol dehydrogenase 10, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh10Q8VCH7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rdh10Q8VCH7 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh10Q8VCH7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms