Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RorbQ8R1B8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RorbQ8R1B8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RorbQ8R1B8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RorbQ8R1B8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms