Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Hecw1Q8K4P8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Hecw1Q8K4P8 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Hecw1Q8K4P8 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms