Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lin28aQ8K3Y3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lin28aQ8K3Y3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms