Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
OptnQ8K3K8 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
OptnQ8K3K8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms