Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
MyripQ8K3I4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MyripQ8K3I4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms