Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Depp1Q8K2F3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Depp1Q8K2F3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms