Protein–RNA interactions for Protein: Q8K203

Neil3, Endonuclease 8-like 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 606 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neil3Q8K203 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Neil3Q8K203 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Neil3Q8K203 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms