Protein–RNA interactions for Protein: Q8K168

1700001C19Rik, RIKEN cDNA 1700001C19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700001C19RikQ8K168 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
1700001C19RikQ8K168 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
1700001C19RikQ8K168 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms