Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Trip10Q8CJ53 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms