Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHK2

Rln3, Relaxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rln3Q8CHK2 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Rln3Q8CHK2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Rln3Q8CHK2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rln3Q8CHK2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Rln3Q8CHK2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Rln3Q8CHK2 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms