Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGF7

Tcerg1, Transcription elongation regulator 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcerg1Q8CGF7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Tcerg1Q8CGF7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Tcerg1Q8CGF7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcerg1Q8CGF7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tcerg1Q8CGF7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms