Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN9

Lrrc9, Leucine-rich repeat-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc9Q8CDN9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrc9Q8CDN9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lrrc9Q8CDN9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lrrc9Q8CDN9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms