Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ccser1Q8C0C4 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Ccser1Q8C0C4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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