Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tnfsfm13Q8BXS2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms