Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTS4

Nup54, Nuclear pore complex protein Nup54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup54Q8BTS4 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nup54Q8BTS4 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nup54Q8BTS4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms