Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Usp54Q8BL06 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Usp54Q8BL06 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Usp54Q8BL06 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms