Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJU2

Tspan9, Tetraspanin-9, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan9Q8BJU2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tspan9Q8BJU2 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tspan9Q8BJU2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms