Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJN4

Fndc9, Fibronectin type III domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc9Q8BJN4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Fndc9Q8BJN4 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Fndc9Q8BJN4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms