Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms