Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG39

Sv2b, Synaptic vesicle glycoprotein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2bQ8BG39 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sv2bQ8BG39 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sv2bQ8BG39 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms