Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFT6

Jmjd4, JmjC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd4Q8BFT6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Jmjd4Q8BFT6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Jmjd4Q8BFT6 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms