Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM4

Hapln4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hapln4Q80WM4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Hapln4Q80WM4 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hapln4Q80WM4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hapln4Q80WM4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Hapln4Q80WM4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hapln4Q80WM4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hapln4Q80WM4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hapln4Q80WM4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Hapln4Q80WM4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms