Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Pcsk9Q80W65 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Pcsk9Q80W65 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms