Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT50

Cdc42bpb, Serine/threonine-protein kinase MRCK beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42bpbQ7TT50 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cdc42bpbQ7TT50 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Cdc42bpbQ7TT50 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms