Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT18

Atf7ip, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf7ipQ7TT18 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf7ipQ7TT18 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Atf7ipQ7TT18 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms