Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ33

Rgmb, RGM domain family member B, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmbQ7TQ33 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RgmbQ7TQ33 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RgmbQ7TQ33 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms