Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPH6

Mycbp2, E3 ubiquitin-protein ligase MYCBP2, mousemouse

Predictions only

Length 4,711 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mycbp2Q7TPH6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Mycbp2Q7TPH6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Mycbp2Q7TPH6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms