Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNU6

Znf250, Zinc finger protein 250, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf250Q7TNU6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Znf250Q7TNU6 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Znf250Q7TNU6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms