Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Uhrf2Q7TMI3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms