Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TwistnbQ78WZ7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
TwistnbQ78WZ7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms