Protein–RNA interactions for Protein: Q78J03

Msrb2, Methionine-R-sulfoxide reductase B2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msrb2Q78J03 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Msrb2Q78J03 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Msrb2Q78J03 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms