Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Tmed3Q78IS1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Tmed3Q78IS1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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