Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Higd1cQ76I25 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC14.21□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Higd1cQ76I25 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms