Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trpv1Q704Y3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Trpv1Q704Y3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms