Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWQ0

Syne2, Nesprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 6,874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne2Q6ZWQ0 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Tex30-201ENSMUST00000027215 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC7.71□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.17
Syne2Q6ZWQ0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.18
Syne2Q6ZWQ0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.71□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms