Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Topbp1Q6ZQF0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms