Protein–RNA interactions for Protein: Q6VSS7

Rhox8, Reproductive homeobox 8, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox8Q6VSS7 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Rhox8Q6VSS7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
Rhox8Q6VSS7 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rhox8Q6VSS7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rhox8Q6VSS7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Rhox8Q6VSS7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms