Protein–RNA interactions for Protein: Q6VH22

Ift172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift172Q6VH22 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ift172Q6VH22 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Ift172Q6VH22 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms