Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Ccdc88cQ6VGS5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc88cQ6VGS5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms