Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Timd4Q6U7R4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms