Protein–RNA interactions for Protein: Q6RT24

Cenpe, Centromere-associated protein E, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpeQ6RT24 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CenpeQ6RT24 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CenpeQ6RT24 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms